Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms