Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NKPD1Q17RQ9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms