Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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