Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCOA1Q15788 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms