Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PDCD1Q15116 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PDCD1Q15116 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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PDCD1Q15116 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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