Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms