Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL4A6Q14031 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms