Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PMS2P11Q13670 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PMS2P11Q13670 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PMS2P11Q13670 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PMS2P11Q13670 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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