Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TAS2R1-201ENST00000382492 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RPL35P3-201ENST00000403133 371 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 U62317.5-201ENST00000609268 362 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RPL12P33-201ENST00000485633 492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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