Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LINC01913-201ENST00000398796 1810 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 OR13A1-203ENST00000553795 2078 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LINC00319-202ENST00000448049 3507 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms