Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM2Q13029 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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