Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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