Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CGNL1Q0VF96 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms