Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms