Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSME1Q06323 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms