Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TLE4Q04727 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TLE4Q04727 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms