Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms