Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms