Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPFP62306 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms