Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RPS3AP61247 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms