Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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CLDN15P56746 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CLDN15P56746 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CLDN15P56746 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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CLDN15P56746 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLDN15P56746 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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