Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms