Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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