Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BRCA2P51587 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms