Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms