Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA8P48165 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms