Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms