Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
OTX2P32243 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
OTX2P32243 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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