Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms