Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms