Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCM3P25205 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms