Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms