Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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