Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRCP08575 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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