Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms