Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms