Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms