Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.1 ms