Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms