Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms