Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RUSC1Q9BVN2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RUSC1Q9BVN2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms