Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TXNDC17Q9BRA2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms