Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF25Q9BQ70 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms