Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms