Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms