Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms