Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms