Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC71Q8N4P6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC71Q8N4P6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC71Q8N4P6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC71Q8N4P6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC71Q8N4P6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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LRRC71Q8N4P6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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LRRC71Q8N4P6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC71Q8N4P6 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms