Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms