Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKOR2Q2VWA4 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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